Durante el Cuarto Informe del poder Ejecutivo del estado de Querétaro, el Secretario de Desarrollo Sustentable, Marco Antonio del Prete Tercero, aseveró que quien lleva a cabo el proceso para concretar el decreto de la Peña Colorada como área natural protegida, corresponde a la autoridad federal.
Afirmó el funcionario que es responsabilidad de la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas llevar a cabo el proceso. Mismo que tendrá que hacer los estudios necesarios y convocar a las mesas de diálogo con los implicados en el asunto.